O Programa de Estágio Curricular do Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas (PEC/INI) é regulamentado pela Política de Estágio da Fiocruz. A seleção é feita através de editais públicos, intermediados pelo agente integrador, o Centro de Integração Empresa-Escola (CIEE). São oferecidas vagas de nível médio e superior, de estágio obrigatório e não-obrigatório, conforme a demanda dos vários laboratórios e setores do Instituto.