Os Programas de Pós-graduação Stricto Sensu do INI/Fiocruz compreendem cursos de Mestrado Acadêmico, Doutorado Acadêmico e Mestrado Profissional, além de Pós-doutorado. Eles são oferecidos em uma abordagem interdisciplinar e multiprofissional e têm por objetivo a formação de profissionais de excelência na área da pesquisa clínica. O Instituto oferece dois Programas de Pós-Graduação Stricto Sensu:
- Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosas (PCDI), com os cursos de Mestrado Acadêmico, Doutorado Acadêmico e Pós-Doutorado.
- Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Pesquisa Clínica (PG-PC), com o curso de Mestrado Profissional e o Pós-Doutorado.



